乳酸菌是益生菌菌种的主要来源之一。在乳酸菌中，乳酸杆菌属与动物关系zui密切，它是动物肠道和中占优势的菌群之一。畜禽服用乳酸菌后，乳酸菌可以改变肠道内环境，维持肠道菌群生态平衡，阻止致病菌对肠道的入侵和定植、抑制有害菌繁殖，增强机体的免疫功能和畜禽的抗病能力，预防和抑制肿瘤发生、控制内毒素、改善过敏反应、降低、调节血脂、缓解肝硬化、提高营养利用率、促进营养吸收、产生风味物质、缓解乳糖不耐症、改善便秘、防治腹泻，提高成活率和日增重。乳酸菌是肠道常在菌。

乳酸菌在中的主要作用为增强鸡的抗病力、参与机体的物质代谢、营养转化和合成，从而提高肉鸡的增重、饲料转化率，改善蛋鸡的产蛋率和蛋的品质，并且可以减少养殖环境及粪便中有害气体的含量。另外，乳酸菌还可以取代抗生素发挥抗菌作用，从而提高食品安全。

乳酸菌在养猪中的使用效果也很好，可显著提高猪的日增重、饲料转化率、降低仔猪腹泻和死亡率、改善母猪的力。特别是当猪只处于断乳、运输、转群、产仔、气温突变或患病等应激条件时，应用效果更好。

乳酸菌微生态制剂在复胃动物养殖中的应用要结合复胃动物特殊的生理结构，研制出、实用的产品。内蒙古农业大学“乳品生物技术与工程”教育部重点实验室的科研人员通过、大量的工作，分离出了一些的乳酸菌，如干酪乳杆菌。研究表明，这些乳杆菌表现为良好的耐酸性生长和耐受人工消化液的特性，具备了作为益生菌的首要条件和开发应用的价值。